MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Helicobacter pylori OK310 DNA

Total Repeats: 29875

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020509	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	478429023
2	NC_020509	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429023
3	NC_020509	TG	3	6	138	143	0 %	50 %	50 %	0 %	478429023
4	NC_020509	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	478429023
5	NC_020509	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429023
6	NC_020509	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	478429023
7	NC_020509	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	478429023
8	NC_020509	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429023
9	NC_020509	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429023
10	NC_020509	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429023
11	NC_020509	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	478429023
12	NC_020509	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429024
13	NC_020509	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	478429024
14	NC_020509	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429024
15	NC_020509	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	478429024
16	NC_020509	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429024
17	NC_020509	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	478429024
18	NC_020509	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429024
19	NC_020509	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478429024
20	NC_020509	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	478429025
21	NC_020509	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429025
22	NC_020509	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429025
23	NC_020509	CCGCAG	2	12	1043	1054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478429025
24	NC_020509	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429025
25	NC_020509	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429025
26	NC_020509	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	478429025
27	NC_020509	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	478429025
28	NC_020509	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	478429025
29	NC_020509	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	478429025
30	NC_020509	ACTC	2	8	1377	1384	25 %	25 %	0 %	50 %	478429025
31	NC_020509	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478429025
32	NC_020509	GCT	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429025
33	NC_020509	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	478429025
34	NC_020509	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	478429025
35	NC_020509	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429025
36	NC_020509	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429025
37	NC_020509	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429026
38	NC_020509	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	478429026
39	NC_020509	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	478429026
40	NC_020509	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	478429026
41	NC_020509	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429026
42	NC_020509	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	478429026
43	NC_020509	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	478429026
44	NC_020509	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429026
45	NC_020509	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	478429026
46	NC_020509	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429026
47	NC_020509	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429026
48	NC_020509	CAT	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429026
49	NC_020509	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	478429026
50	NC_020509	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429026
51	NC_020509	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429026
52	NC_020509	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	478429026
53	NC_020509	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	478429026
54	NC_020509	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	478429027
55	NC_020509	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	478429027
56	NC_020509	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	478429027
57	NC_020509	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	478429027
58	NC_020509	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	478429027
59	NC_020509	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	478429027
60	NC_020509	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	478429027
61	NC_020509	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429027
62	NC_020509	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429027
63	NC_020509	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429027
64	NC_020509	TGC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429028
65	NC_020509	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	478429028
66	NC_020509	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	478429028
67	NC_020509	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	478429028
68	NC_020509	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	478429028
69	NC_020509	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429028
70	NC_020509	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	478429028
71	NC_020509	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429028
72	NC_020509	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478429028
73	NC_020509	TCGC	2	8	5382	5389	0 %	25 %	25 %	50 %	478429029
74	NC_020509	T	6	6	5390	5395	0 %	100 %	0 %	0 %	478429029
75	NC_020509	CATT	2	8	5455	5462	25 %	50 %	0 %	25 %	478429029
76	NC_020509	ATT	2	6	5477	5482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
77	NC_020509	TGG	2	6	5575	5580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429029
78	NC_020509	A	6	6	5687	5692	100 %	0 %	0 %	0 %	478429029
79	NC_020509	A	6	6	5729	5734	100 %	0 %	0 %	0 %	478429029
80	NC_020509	GTT	2	6	5777	5782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
81	NC_020509	TAA	2	6	5846	5851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429029
82	NC_020509	GTTGA	2	10	5870	5879	20 %	40 %	40 %	0 %	478429029
83	NC_020509	TTA	2	6	5904	5909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
84	NC_020509	GTG	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429029
85	NC_020509	GTT	2	6	5993	5998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
86	NC_020509	GTGC	2	8	6033	6040	0 %	25 %	50 %	25 %	478429029
87	NC_020509	TCT	2	6	6117	6122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429029
88	NC_020509	AGT	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429029
89	NC_020509	TTTGA	2	10	6248	6257	20 %	60 %	20 %	0 %	478429029
90	NC_020509	GCTTGC	2	12	6279	6290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429029
91	NC_020509	AGA	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429029
92	NC_020509	TCA	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429029
93	NC_020509	CTG	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429029
94	NC_020509	TGT	2	6	6637	6642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
95	NC_020509	ACC	2	6	6647	6652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429029
96	NC_020509	TTA	2	6	6669	6674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
97	NC_020509	CCG	2	6	6690	6695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429029
98	NC_020509	GTTT	2	8	6708	6715	0 %	75 %	25 %	0 %	478429029
99	NC_020509	GTT	2	6	6752	6757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
100	NC_020509	TTG	2	6	6794	6799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
101	NC_020509	TGGT	2	8	6908	6915	0 %	50 %	50 %	0 %	478429029
102	NC_020509	ATCG	2	8	7091	7098	25 %	25 %	25 %	25 %	478429029
103	NC_020509	ATTG	2	8	7103	7110	25 %	50 %	25 %	0 %	478429029
104	NC_020509	CAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
105	NC_020509	GCC	2	6	7654	7659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429030
106	NC_020509	C	6	6	7682	7687	0 %	0 %	0 %	100 %	478429030
107	NC_020509	TCT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
108	NC_020509	GAAACC	2	12	7763	7774	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	478429030
109	NC_020509	AAT	2	6	7813	7818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429030
110	NC_020509	CTT	2	6	7821	7826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
111	NC_020509	TTCA	2	8	7891	7898	25 %	50 %	0 %	25 %	478429030
112	NC_020509	CAT	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
113	NC_020509	GC	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	478429030
114	NC_020509	ATG	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429030
115	NC_020509	TCA	2	6	7988	7993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
116	NC_020509	CCG	2	6	8042	8047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429030
117	NC_020509	CTT	2	6	8061	8066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
118	NC_020509	TCA	2	6	8096	8101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
119	NC_020509	T	6	6	8110	8115	0 %	100 %	0 %	0 %	478429030
120	NC_020509	AG	3	6	8170	8175	50 %	0 %	50 %	0 %	478429030
121	NC_020509	TCTT	2	8	8185	8192	0 %	75 %	0 %	25 %	478429030
122	NC_020509	CAT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
123	NC_020509	TTC	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
124	NC_020509	CCG	2	6	8396	8401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429030
125	NC_020509	TTTCT	2	10	8427	8436	0 %	80 %	0 %	20 %	478429030
126	NC_020509	CAC	2	6	8497	8502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429030
127	NC_020509	GAT	2	6	8539	8544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429030
128	NC_020509	T	6	6	8571	8576	0 %	100 %	0 %	0 %	478429030
129	NC_020509	TAG	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429030
130	NC_020509	GAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429030
131	NC_020509	T	7	7	8610	8616	0 %	100 %	0 %	0 %	478429030
132	NC_020509	GA	3	6	8685	8690	50 %	0 %	50 %	0 %	478429030
133	NC_020509	CTT	2	6	8751	8756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
134	NC_020509	TCT	2	6	8861	8866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
135	NC_020509	T	6	6	8878	8883	0 %	100 %	0 %	0 %	478429030
136	NC_020509	T	6	6	8890	8895	0 %	100 %	0 %	0 %	478429030
137	NC_020509	TAA	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429030
138	NC_020509	CTT	2	6	8982	8987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
139	NC_020509	AAGC	2	8	9000	9007	50 %	0 %	25 %	25 %	478429030
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142	NC_020509	T	6	6	9162	9167	0 %	100 %	0 %	0 %	478429030
143	NC_020509	T	6	6	9316	9321	0 %	100 %	0 %	0 %	478429031
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155	NC_020509	AGA	2	6	10255	10260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429032
156	NC_020509	ACC	2	6	10263	10268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429032
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279	NC_020509	CTT	2	6	15825	15830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429037
280	NC_020509	AAG	2	6	15866	15871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429037
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